Con ella el autor queda incluido en la primera promoción de médicos que hicieron descripción de la terrible epidemia, y es uno de los primeros tratados que en España introduce la teoría de los seminaria de Fracastoro como explicación del contagio. Su planteamiento médico es muy afín al de Mercado sobre todo en lo referente a las medidas preventivas. Por otra parte, este tratado se sitúa también en el ámbito de la medicina personal al tomar en consideración las complexiones de cada sujeto, su edad y naturaleza, con el fin de aplicar las medidas adecuadas.
El primer tratado consta de tres partes:
El Arte de descontagiar va añadido como cuarta parte. El Dr. Freylas propone medidas higiénicas de carácter profiláctico y preventivo en circunstancias tan dramáticas como fue el terrible brote de peste de 1602 en Jaén. (M. D. Rincón)